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Primera Etapa - Falta de Desarrollo
La etapa inicial se caracteriza por el bajo peso al nacer y la subsecuente falta de desarrollo, una severa debilidad de los músculos (hipotonía) y un significante retraso en el crecimiento, Frecuentemente los infantes no pueden mamar o chupar debido a la debilidad y flacidez de sus músculos, y puede llegar a ser necesario usar otras técnicas especiales para alimentarlos. Progresos como, levantar la cabeza, sentarse, gatear, caminar y hablar tienden a realizarse con retraso. En promedio, el sentarse por sí solos se logra alrededor de los 12 a los 13 meses, el caminar, de los 24 a los 30 meses, y el andar en triciclo a los 4 años. La primera palabra puede ser dicha alrededor de los 21 meses, y frases a los 3 años y medio.
Segunda Etapa - Desarrollarse demasiado Bien
La siguiente etapa se manifiesta por "desarrollarse casi demasiado bien". Generalmente la compulsión de comer se hace patente cuando empiezan a caminar. Su vida se ve dominada por un apetito voraz y una fuerte compulsión por la comida. Los individuos con el síndrome de Prader-Willi nunca se sienten llenos. Ellos pueden comer grandes cantidades de comida sin sentir nauseas o tener indigestión - y muchos nunca han vomitado. Además de su deseo de comida, también aumentan rápidamente de peso aun con relativamente pocas calorías. Por lo que si no se le controla, el niño puede llegar a ser obeso con rapidez. La grasa tiende a acumularse en la parte baja del torso, los glúteos, las caderas, los muslos y el abdomen. Una obesidad desenfrenada puede llevar a enfermedades como alta presión sanguínea, problemas del aparato respiratorio, enfermedades del corazón, diabetes, y a otras más.