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Crecimiento anormal: Típicamente, las personas con PWS tienen poca estatura (generalmente la estatura de un adulto es de cinco pies), tienen manos y pies pequeños, frente estrecha y sufren de escoliosis (curvatura de la columna vertebral).
Utilización anormal de calorías: Las personas con PWS tienden a subir de peso con un consumo de calorías considerablemente menor que el de la población normal.
Desarrollo sexual incompleto: Esto se puede identificar más fácilmente en los varones debido a los pequeños genitales, pero afecta a ambos sexos. El desarrollo puede empezar a temprana edad, pero se detiene antes de alcanzar el nivel de adulto normal. La infertilidad es normal en estos casos.
Limitaciones cognoscitivas: El debilitamiento del sistema nervioso central tiene como resultado un coeficiente de inteligencia (IQ) que va de 40 hasta más de 100, sin embargo, alrededor de un noventa y cinco por ciento (95 %) de todas las personas afectadas funcionan con un leve margen de retraso mental, independientemente del coeficiente comprobado. Muchos serán clasificados también como incapacitados para aprender.
Dificultades en el habla y de lenguaje: Esta habilidad se ve afectada por la capacidad cognoscitiva y el grado de hipotonía, por lo que frecuentemente se requiere de terapia.
Gran tolerancia al dolor e irregularidades en el mecanismo de control de la temperatura corporal: La mayoría de las personas con PWS no se dan cuenta de que tienen infecciones y lesiones debido al embotamiento de sus mecanismos sensoriales.
Escarbarse y rascarse la piel: Las personas que tienen PWS, frecuentemente se rascan y se escarban las llagas o piquetes de insectos, lo que, si no es controlado, puede tener como consecuencia infecciones.
Problemas dentales: Pueden incluir caries, reblandecimiento del esmalte dental, y saliva espesa, seca y pegajosa. Estos problemas se agudizan debido a una higiene oral deficiente.
Temperamento: En sus primeros años, tienden a estar contentos, a ser cariñosos, y obedientes después de un tiempo ocurren cambios sutiles que pueden tener como consecuencia cambios en el estado de animo y un comportamiento difícil. Esto puede incluir arranques de mal genio, testarudez, rigidez, propensión a discutir, y pensamientos y comportamiento repetitivos.
Balance y coordinación: Las habilidades motores finas generalmente se desarrollan bien, mientras que las gruesas permanecen limitadas.
Aislamiento social: Puede hacer depresión años más tarde, cuando surgen cuestiones relativas a la auto-imagen, debido al conflicto entre la independencia y la necesidad de ser controlado.
Otras condiciones que se han encontrado pueden incluir: Las personas con PWS pueden sufrir un incremento en el porcentaje de problemas psiquiátricos. Además de una excesiva somnolencia durante el dÍa y apnea (suspensión transitoria de la respiración) durante el sueño; anormalidades en los ojos, como estrabismo (ojos cruzados), miopía (corto de vista) o ambleopía (visión obscura), son comunes.